El Subdepartamento de Oncología y Radioterapia del Hospital Base de Valdivia es Centro de Referencia supra regional con más de 50 años de trayectoria, siendo uno de los cinco centros nacionales de Radioterapia con los que cuenta el Ministerio de Salud, y desde hace varios años es el principal centro de derivación para pacientes con cáncer de la zona sur del país, brindando atención a beneficiarios de FONASA, ISAPRES y en convenio que se hallan geográficamente distribuidos entre las regiones de la Araucanía y Magallanes.